분자 세계의 보물찾기

방대한 논문을 한데 묶어서 이전에 미처 발견하지 못했던 유전자나 단백질의 경로를 밝혀내는 소프트웨어.
글 | Gary Stix
















1996년 안드레이 레츠스키(Andrey Rzhetsky)가 과학 연구원 신분으로 컬럼비아 대학교에 도착했을 때 그가 참여한 첫 번째 프로젝트는 왜 만성 림프구성 백혈병에서는 림프구라고 하는 백혈구가 죽지 않는지를 이해하기 위한 문서 검색과 관련되어 있었다. 이 수학-생물학자는 세포자멸사(예정된 세포의 죽음)와 암에 대한 수백편의 논문을 찾아냈다. 하지만 그가 일 분, 일 초를 모두 바친다고 하더라도 저널에 실린 모든 사항을 샅샅이 훑어본다는 것은 불가능했을 것이다. 설상가상으로 이것은 그저 빙산의 일각일 뿐 전 과정을 이해하는 데에는 턱없이 부족하다고 그는 개탄했다.

이러한 경험이 그로 하여금 이 첫 번째 프로젝트를 훨씬 쉽게 만들어 줄 수 있었을만한 아이디어를 떠올리게 했다. 모든 관련 문헌을 찾아내고 읽어야 하는 어마어마한 작업을 대신 해줄 수 있는 자동 검색 도구가 바로 그것이다. 그러나 이 도구는 사실 그 이상을 해낼 수 있을 지도 모른다. 마치 우리 사람이 하는 일처럼 데이터간의 패턴을 발견해내서 기계가 스스로 연구를 수행할 수 있도록 하는 것이다!.....